陕西省西安植物园（陕西省植物研究所）在化香树基因组学研究方面取得新进展

　　       近日，陕西省西安植物园周惠娟博士以第一作者身份在学术期刊《Scientific Data》（IF=9.8003，JCR: Q1）在线发表了题为“Chromosome-level genome assembly of Platycarya strobilacea” 的研究论文。

　　化香树（Platycarya strobilacea）隶属于胡桃科化香树属，为东亚地区特有种，广泛分布于中国、韩国、日本以及越南地区，具有重要的生态价值，可用于园林绿化，以及清热解毒、抗氧化等药用价值。本研究利用二代测序、三代测序、Hi-C测序、不同组织三代全转录组学及二代转录组学测序组装提升并得到了化香树的高质量染色体水平基因组。全基因组大小为677.30 Mb，共注释得到32,246个蛋白质编码基因，scaffold N50值为43.67 Mb，98.43%成功挂载到了15条染色体上。该研究结果可为被子植物及胡桃科植物系统进化和比较基因组学研究提供重要的数据基础。

图1 化香树形态和染色体水平基因组特征

　　我园周惠娟博士为论文第一作者，陕西省西安植物园为第一完成单位。该研究得到了陕西省科学院项目（2023K-26, 2023K-49），陕西省林业科学研究院科技研发重点专项（SXLK2023-02-20）和国家自然科学基金（32370386, 32070372, 32200295）等项目的资助。

　　原文链接：https://www.nature.com/articles/s41597-024-03107-4